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在机器学习领域，聚类分析是一种重要的无监督学习方法，广泛应用于数据挖掘、图像处理、市场细分等多个领域。本文将深入探讨层次聚类算法，包括其基本介绍、算法原理以及一个完整的案例分析，帮助读者全面理解和掌握这一经典的聚类方法。 层次聚类 ...

图1. 易宏基因组的工作流程：分析宏基因组测序从原始数据到物种和功能组成表. 从原始数据到物种和功能组成表可分为四步进行：1.数据的预处理,包括分析前准备工作(安装软件和数据库、环境变量设置和元数据和序列文件检查)、Fastp质量控制和Kneaddata去宿主。

一般情况下，我们都是使用散点图进行聚类可视化，但是某些的聚类算法可视化时散点图并不理想，所以在这篇文章中，我们介绍如何使用树状图（Dendrograms）对我们的聚类结果进行可视化。 一般情况下，我们都是使用散点图进行聚类可视化，但是某些的聚类 ...

相关性热图 (Correlation Heatmap) 的使用在微生物组研究中非常普遍，尤其是线面组合的相关性热图，其中的相关性热图通常表示环境因子间的Pearson相关系数，连线则表示物种组成与各环境因子的Mantel相关性。本期我们挑选2023年1月9日刊登在iMeta上的Destabilized microbial ...

ggplot2是由Hadley Wickham创建的一个十分强大的可视化R包。在使用R作图时，如何使用ggplot2来调整图像中的颜色呢？下面跟着我们一起学习ggplot2的颜色修改函数，制作出更加绚丽多彩的图片。 在ggplot2中，对于线和点的颜色调整可以直接改变colour参数，如设置colour ...

作者：鲁伟，热爱数据，坚信数据技术和代码改变世界。R语言和Python的忠实拥趸，为成为一名未来的数据科学家而奋斗终生。个人公众号：数据科学家养成记 （微信ID：louwill12） 看到标题你可能会有疑问，ggplot2的水平版本又是什么鬼，其实没那么玄乎，就是把 ...